Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HMGB1P1B2RPK0 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms