Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 SYBU-203ENST00000408889 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ARHGEF10-203ENST00000398560 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 IGHG2-202ENST00000641095 2594 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 NR4A3-203ENST00000395097 3794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 TEX35-203ENST00000367641 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 MAN2B1-201ENST00000221363 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ZNF473-203ENST00000445728 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 DNAI2-202ENST00000446837 2474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 LOXL2-201ENST00000389131 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 NUMB-212ENST00000554546 3607 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 LAMB3-202ENST00000367030 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
VGLL3A8MV65 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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