Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EPOPA6NHQ4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms