Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CFAP69A5D8W1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CFAP69A5D8W1 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms