Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA6A0AVT1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms