Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BIVM-ERCC5R4GMW8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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