Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SH3BP1Q9Y3L3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms