Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRG3Q9Y2Y8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms