Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ERVW-1Q9UQF0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERVW-1Q9UQF0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms