Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC23Q9UJX2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms