Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII6

DUSP13, Dual specificity protein phosphatase 13 isoform B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP13Q9UII6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
DUSP13Q9UII6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms