Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
APEX2Q9UBZ4 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APEX2Q9UBZ4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms