Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
COPS7AQ9UBW8 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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