Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CTNNAL1Q9UBT7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CTNNAL1Q9UBT7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms