Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SCHIP1Q9P0W5 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms