Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYH9

UTP6, U3 small nucleolar RNA-associated protein 6 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP6Q9NYH9 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UTP6Q9NYH9 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms