Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PKDREJQ9NTG1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PKDREJQ9NTG1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms