Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CYLDQ9NQC7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CYLDQ9NQC7 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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