Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TIMMDC1Q9NPL8 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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