Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FANCFQ9NPI8 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FANCFQ9NPI8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms