Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP29Q9HBJ7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms