Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 NAMA-205ENST00000605043 551 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE4DIP-249ENST00000620605 823 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CU633967.1-205ENST00000624368 1140 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RCL1-208ENST00000448872 1459 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 NUCB2-201ENST00000323688 1905 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CREM-212ENST00000374728 1933 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA7-202ENST00000356583 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM106B-202ENST00000396668 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 APTX-205ENST00000379819 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AKT3-204ENST00000366540 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 BIN2P2-201ENST00000503900 1303 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL1-202ENST00000331018 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL17P34-201ENST00000394133 555 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 C19orf38-201ENST00000397820 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AL031575.1-201ENST00000416609 845 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008758.2-201ENST00000420038 695 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC132217.1-201ENST00000430034 373 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RBMY2AP-201ENST00000445405 1157 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RBMY2CP-201ENST00000448575 1157 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RBMY2DP-202ENST00000448881 1157 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 KRT18P26-201ENST00000454475 1281 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 TAAR3P-202ENST00000481759 1025 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL5P29-201ENST00000482972 894 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AP002852.1-201ENST00000489699 385 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL22-208ENST00000497965 786 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPN20-214ENST00000503851 545 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPN20-220ENST00000508715 586 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01288-201ENST00000519189 529 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC022639.1-203ENST00000521958 579 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC044839.1-201ENST00000532307 541 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AL591767.2-201ENST00000554984 173 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP9-9Q9BYP9 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms