Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PI4K2AQ9BTU6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms