Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LPIN3Q9BQK8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms