Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 IL20RB-AS1-201ENST00000462176 562 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms