Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DUSP9Q99956 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DUSP9Q99956 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms