Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VAT1Q99536 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms