Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf72Q96LT7 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms