Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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SGCZQ96LD1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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SGCZQ96LD1 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SGCZQ96LD1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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