Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDK5RAP3Q96JB5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms