Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HERVK_113Q902F9 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms