Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA8

HTR3C, 5-hydroxytryptamine receptor 3C, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3CQ8WXA8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR3CQ8WXA8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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