Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM41Q8WV44 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms