Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM35BQ8NCS4 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM35BQ8NCS4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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TMEM35BQ8NCS4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMEM35BQ8NCS4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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TMEM35BQ8NCS4 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM35BQ8NCS4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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