Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SUMF1Q8NBK3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SUMF1Q8NBK3 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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