Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FAM71DQ8N9W8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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