Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00612Q8N6U2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms