Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMC1Q7Z7K0 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMC1Q7Z7K0 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMC1Q7Z7K0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMC1Q7Z7K0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CMC1Q7Z7K0 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CMC1Q7Z7K0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms