Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTF1AQ7RTS3 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms