Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HECW1Q76N89 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms