Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMBR1LQ6UX01 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms