Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PERM1Q5SV97 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms