Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SPANXN3Q5MJ09 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms