Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC93Q567U6 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms