Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q499Y3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q499Y3 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q499Y3 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms