Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FHOD3Q2V2M9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms