Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL40Q2TBA0 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL40Q2TBA0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms