Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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GEN1Q17RS7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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