Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC18A3Q16572 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC18A3Q16572 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148 ms