Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIP4Q15650 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms